AU 电子邮件列表 B2C 电子邮件列表 估读取对齐器准确性的理

估读取对齐器准确性的理

检测-seq数据的外显子-外显子连接也有效。使用插入缺失失并确定其大小,可以实现高度准确的插入缺失检测。indel检测的开销计算成本很小,因为indel检测只需要那些未被成功投票的子读覆盖的区域。为了检测外显子连接,该算法使用从连接读取中提取的子读取投票选出的最佳两个映射位置来生成一组候选外显子-外显子连接,然后对其进行严格的验证以实现高检测精度。我们使用各种数据集来证明该范例相对于现有

对准器的性能 特别是,我们使用掺入对照进行评

估。事实证明,加标数据集对于评估为分析微阵列数据而开发的方法立陶宛电邮清单是有效的(、-))。据我们所知,我们的研究首次使用掺入对照来评估用于绘制下一代测序数据的读取对齐器的性能。掺入转录本的公正设计及其已知的浓度和倍数变化使它们成为评想选择。在此比较中,我们发现我们的ubread对准

器明显优于其他对准器 此外,我们使用-seq数

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据、enomes外显子组测序数据和模拟数据来演示ubread和junc的性能。在所有评估数非盟电子邮件列表据集中,种子和投票范式表现出比种子和扩展方法更高的准确性和更高的映射速度,并且召回成本很低。尤其,ubread和ubjunc允许调整读取映射中使用的内存。这为它们在不同配置的计算机上运行提供了极大的灵活性。当整个哈希表索引一次性加载到内存中时,ubread和ubjunc实现了最高的映射速度,当将读取映射到人类或小鼠基因组时,分别需要和内存。ubread使用的内存量与ovoalign、aq和rsast相当或更好,但高于owtie和。由于现在的计算机都配备了大内存,例如lade超级

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