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第一个碱基或最后一个碱完成后发现假定的拼接点没有任何支持读数,则从最终点。此两次扫描过程的最终输出是经过验,其中包含支持读取的数量,以及每个读取的完整映射结果,包括字符串,它描述了每个读取中的每个碱基是如描将使用第一次扫描的输出对每个读取(包读取的读取,其只有一个候选映射位置)执行完整读取对齐。第二次扫描还充当验查每次读取的所有映射可能性,并为它们

扫描发现的外显子-外显子连接点,

 

并删连接点。第一次扫描的输出包括发现的假定外显子-外显子连接和读数的锚信息。对于每个read,其在基因组中的锚位置是投票选出该read的最佳映射位置的子read集合中最左侧子read的最左侧瓦努阿图电子邮件列表碱基的映射位置,并且每个读取中的锚定区域是由投票选出最佳映射位置的子读取集所跨越的区域,并且读取中的锚定区域映射到的基因组中的区域是其在基因组中的锚保存的锚位置允许第二次

检索落入第一次扫描发现的读取范

 

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过涉及几次,如图所示。当使用显子连接表中搜索第一次扫描发现非盟电子邮件列表的该片段的剪接点时,发现片段包含位于锚点右侧的假定连接断点(图)。为了的连接,我们检查在映射结果中包含该连参考基因组的序列相似性。如果包含此连接,则可以通过计算基因组中此读数的锚点位置(与位之间的距离来计算出其在读数中的位置基因组中的剪接点

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