许不匹配候选映射

口寻找潜在的插入缺失匹配时,在新选投票映射范例。()所提出的映射范例的示意图。子读取(或种子)是从每次读取中提取的短连续序列。绿色子字符串是无信息的子读,它们被排除在投票之外。小红条表示碱基不匹配。读取的细实箭头指向最大共识位置。读取的映射位置(如黑色向上三角形所示)由最大共识集中的所有子读取投票选出。虚线箭头表示子读的其他映射位置,这些位置由于投票数不足而被忽略。(乙)使用一个人工

示例来说明式 从人工阅读中提取六个子

方括号表示一个提取的子读,其中包含五个连续碱基,蓝色循环中嵌入的数字表示子读编号。每个子读的碱基序列被编码圣诞岛电子邮件列表成一串和(每个碱基被编码成位二进制数)。每个子读取的编码值用作哈希表中的键。键的值给出了基因组中与相应子读完全匹配的染色体位置(不允位置,分别获得、、和票(共识子读取的数量)。获得最多票数的位置,在本例中为获得五工读

取的最终映射位置 在范例下进行

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的插入缺失检测。()显示当在读子读取结果(为简单起非盟电子邮件列表见假设读取中()分别示出了在read中发现插入或缺失且在插入或缺失两侧均发现侧翼子read的情况下检失(el)的示意图插入缺失的原理图,当它们出现在靠近读取末尾的位置时,侧翼子读取只能在一侧找到。在()和()中,红色箭头指向的染色体位置分别是子读段、和的真实映射位置,黑色虚线箭头指

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