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给出了成功映射的读取

的百分比(在“全部”类别中,最大错误率为%)、所用时间和峰值内存使用情况。给出了使用默认设置和设置为使用较少内存时的子读取的结果。在新选项卡中打开随着读取时间变长,子读取的速度优势就会增加。对于映射bp读取,子读取的速度是第二快的速度的七倍(补充表)。对于如此长度的读取,只有ubread、owtie和能够成功完成任务。接下来,我们在-seq数据上比较了对齐器。在此数据上,ubread绘制了迄今为止所有比对器中最高

百分比的读数,同时保持了与读数相同的相对速度优势(表)

 虽然此处可以使用opat或applice等连接检测器来实现与ubread相当的映射百分比,但这需要>倍的计算时间(表),使得该路线对于常规全基因组表达谱分析的吸引力较低。表比对仪在映射来自项目的-seq读数时的性能对准器映射(%)时间(分钟)内存()子读(默认)子读(低内存)特立尼达和多巴哥电子邮件列表领结世界银行第章马克第章诺沃利第章法斯特夫人第章列百分比、所花费的时间和峰值内存使用情况。给出了使用默认设置和设置为

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的表达水平我们首先通过对掺入的转录本进行测序,并将每个转录本的读取计数覆盖率与该转录本的非盟电子邮件列表达水平进行比较来检查准确性。()项目现来评估使用下一代测序技术的实验室间一致性。本研究中包含的-seq数据集包含测序的读数从这些spike-in转录本中,除了从和样本测序的reads之外,每个spike-in转录本序列都包含一串连续的碱基,并且这些序列中没有外显子-外显子连接。转录本中的浓度范围很大,这使得它们可用于评估为处理下一代测序数据而开发的方法。将一

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